В последние два года в новостных сводках он чаще появлялся как фигурант уголовного дела о вырубке леса в водоохранной зоне озера Байкал.
Алексей Щепин все-таки покидает Минприроды Карелии. Эту информацию официально подтвердили в самом ведомстве. С 2017 года он трудился министром природных ресурсов и экологии Республики Карелия, с 2021 года после истории с вырубками леса на Байкале, он замещал должность первого заместителя министра.
В Минприроды Карелии отметили, что благодаря непосредственному участию Алексея Щепина была обновлена материально-техническая база лесничеств, Минприроды Карелии, увеличены объемы лесовосстановительных работ в регионе, проведена реструктуризация Карельского центра охраны и защиты лесов, выведено из банкротства учреждение по выращиванию сеянцев АУ РК «Кареллесхоз».
Однако с 2021 года Алексей Щепин оказался в центре неприятной уголовной истории. Наш портал рассказывал об уголовном деле бывшего министра. Дело расследовалось в Бурятии, где Щепин более 10 лет назад возглавлял Республиканское агентство лесного хозяйства. Дело было возбуждено из-за вырубленных 20 гектаров леса в Кабанском районе в ЦЭЗ Байкальской природной территории и водоохранной зоны озера Байкал.
В июле 2021 года суд в Улан-Удэ приговорил Щепина к четырем годам лишения свободы условно с лишением права занимать определенные должности. В мае 2022 года Восьмой кассационный суд в Кемерове оставил в силе обвинительный приговор. В феврале 2022 года прокуратура Бурятии подала к Щепину иск на 28,8 млн рублей с требованием компенсации ущерба за рубку леса у озера. Суд первой инстанции удовлетворил иск, однако Щепин подал жалобу в Верховный суд Карелии. В октябре 2022 года решение о такой сумме устоялось.
После приговора суда в июле 2021 года Щепин уволился по собственному желанию с поста регионального министра природных ресурсов и экологии. Правда, из правительства не ушел. До настоящего момента он занимал должность первого заместителя министра природных ресурсов Карелии.
