Отмечается, что часовня была построена в середине XIX века и располагалась рядом с Петровским сквером. Она была разрушена после революции 1917 года, а в 2025-м воссоздана благодаря усилиям Петрозаводской епархии и неравнодушных горожан.
Эскиз нового строения был выполнен по сохранившимся фотографиям и картинам, в частности — по полотну Василия Пармакова «Общественная пристань в Петрозаводске», написанному в 1850-х. Часовня когда-то была приписана к Святодуховскому собору, ее строили по благословению архиепископа Игнатия и стараниям купца Ивана Феклистова.