Музей «Кижи» продолжает проект по научному изучению потолочной живописи Преображенской церкви. «Небеса» были утрачены в годы Великой Отечественной войны. В фондах музея-заповедника «Кижи» сохранились только удерживающие конструкции потолка.
На черно-белых фотографиях финского исследователя Ларса Петтерссона запечатлены лики и сюжеты кижских небес. В архивах Финляндии сохранилось текстовое описание цветов потолочной живописи, в том числе заметки Л. Петтерссона о темном сине-зелёном цвете фона «неба» и лососёво-красном оттенке мандорлы центрального медальона «Новозаветная Троица».
О восстановлении «небес» задумывались ещё в 50-х годах прошлого века. Сегодня перед учеными музея стоит задача изучить потолочную живопись главного храма острова Кижи. Научные исследования проводятся с 2020 года.
В настоящее время специалисты Санкт-Петербургской академии художеств имени Ильи Репина работают над колерной картой иконостасных икон церкви, а также составляют выкраски потолочных икон храмов Заонежья, схожих по времени и написанию с комплексом икон Преображенской церкви. Руководит процессом заслуженный художник России, искусствовед, профессор Российской академии художеств Александр Крылов.
Научное исследование живописи «неба» церкви Преображения Господня проводится при поддержке Министерства культуры России и на средства «Газпрома».